Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C11orf49Q9H6J7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms