Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms