Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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