Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms