Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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