Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms