Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms