Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms