Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms