Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGMNQ99538 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms