Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDRT15Q96T59 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms