Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms