Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms