Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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