Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms