Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms