Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF501Q96CX3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms