Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms