Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF34Q969K3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms