Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCC1Q92922 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCC1Q92922 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCC1Q92922 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCC1Q92922 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms