Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms