Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF4Q8WXU2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms