Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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COPS9Q8WXC6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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COPS9Q8WXC6 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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COPS9Q8WXC6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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COPS9Q8WXC6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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COPS9Q8WXC6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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COPS9Q8WXC6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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COPS9Q8WXC6 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COPS9Q8WXC6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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