Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY2Q8WXA3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms