Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF4Q8WV16 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF4Q8WV16 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms