Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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FAT3Q8TDW7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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FAT3Q8TDW7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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FAT3Q8TDW7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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FAT3Q8TDW7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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FAT3Q8TDW7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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