Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

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Length 2,946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NBEAQ8NFP9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NBEAQ8NFP9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NBEAQ8NFP9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NBEAQ8NFP9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NBEAQ8NFP9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NBEAQ8NFP9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NBEAQ8NFP9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NBEAQ8NFP9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NBEAQ8NFP9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NBEAQ8NFP9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NBEAQ8NFP9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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