Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms