Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMNTD1Q8N9Z9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms