Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAAF3Q8N9W5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms