Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms