Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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CLDN19Q8N6F1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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CLDN19Q8N6F1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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CLDN19Q8N6F1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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CLDN19Q8N6F1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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CLDN19Q8N6F1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN19Q8N6F1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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