Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms