Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms