Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms