Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9AQ7Z3C6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG9AQ7Z3C6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG9AQ7Z3C6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG9AQ7Z3C6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG9AQ7Z3C6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9AQ7Z3C6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9AQ7Z3C6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9AQ7Z3C6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9AQ7Z3C6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms