Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms