Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms