Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms