Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX04

CWC27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC27Q6UX04 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CWC27Q6UX04 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms