Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 DNAJC8-206ENST00000603289 483 ntTSL 56.79□□□□□ -1.324e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.334e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ABCD4-216ENST00000493752 719 ntTSL 36.65□□□□□ -1.344e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RBM22-201ENST00000199814 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.354e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.353e-22■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.364e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DNAJA2-204ENST00000617000 1885 ntTSL 26.49□□□□□ -1.374e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 LINC01426-201ENST00000419921 767 ntTSL 36.47□□□□□ -1.374e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ARL6IP5-201ENST00000273258 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.384e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.384e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CCDC77-212ENST00000543504 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.394e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 AC087632.1-204ENST00000635160 692 ntTSL 46.39□□□□□ -1.394e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RAP1GDS1-210ENST00000507303 875 ntTSL 36.37□□□□□ -1.394e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CDC25C-204ENST00000503022 1059 ntTSL 36.35□□□□□ -1.392e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SAMD4A-211ENST00000557013 3637 ntTSL 1 (best)6.34□□□□□ -1.394e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CREBRF-204ENST00000520464 5163 ntTSL 26.32□□□□□ -1.44e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MEIS1-216ENST00000560281 2773 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.44e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 FAM45A-210ENST00000498549 499 ntTSL 36.28□□□□□ -1.44e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.44e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SLIRP-204ENST00000555890 471 ntTSL 26.27□□□□□ -1.414e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CCDC77-203ENST00000422000 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.414e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.424e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SENP5-205ENST00000448068 484 ntTSL 26.19□□□□□ -1.423e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DLG3-209ENST00000496931 604 ntTSL 36.14□□□□□ -1.434e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ADAL-205ENST00000563551 475 ntTSL 56.14□□□□□ -1.434e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.434e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 NUP54-204ENST00000506098 548 ntTSL 46.06□□□□□ -1.444e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SAMD4A-212ENST00000557692 1119 ntTSL 25.99□□□□□ -1.454e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.96□□□□□ -1.464e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.464e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.474e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CSNK1G1-217ENST00000635514 790 ntTSL 55.84□□□□□ -1.474e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.481e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CSNK1G1-215ENST00000635359 333 ntTSL 25.77□□□□□ -1.494e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.491e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.491e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF544-207ENST00000596677 4109 ntTSL 55.74□□□□□ -1.491e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 LINS1-202ENST00000559149 2477 ntTSL 25.72□□□□□ -1.494e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SERAC1-204ENST00000606965 1826 ntTSL 1 (best)5.71□□□□□ -1.54e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.54e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 HAT1-202ENST00000392584 3609 ntTSL 25.67□□□□□ -1.54e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.54e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 IVNS1ABP-208ENST00000491112 591 ntTSL 25.65□□□□□ -1.511e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZBTB8OS-214ENST00000492007 817 ntTSL 35.64□□□□□ -1.515e-11■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 NIN-210ENST00000476352 10225 ntTSL 55.59□□□□□ -1.514e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 FAM45A-207ENST00000489988 2586 ntTSL 25.56□□□□□ -1.524e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CCT8-205ENST00000475205 431 ntTSL 25.54□□□□□ -1.524e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.534e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 GOLT1B-207ENST00000542194 562 ntTSL 35.47□□□□□ -1.534e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.554e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZBTB8OS-213ENST00000483138 680 ntTSL 35.35□□□□□ -1.555e-11■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.574e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.574e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MPP1-215ENST00000488754 553 ntTSL 35.2□□□□□ -1.582e-25■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.584e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.584e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.584e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.594e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC30A5-208ENST00000513937 555 ntTSL 35.05□□□□□ -1.64e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 GOLT1B-208ENST00000545093 700 ntTSL 25.04□□□□□ -1.64e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.614e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.614e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.624e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 NUP54-218ENST00000515460 849 ntTSL 34.92□□□□□ -1.624e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DMTF1-225ENST00000578926 438 ntTSL 34.9□□□□□ -1.634e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 BTAF1-202ENST00000471217 2003 ntTSL 1 (best)4.9□□□□□ -1.634e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 GOLT1B-203ENST00000539025 1210 ntTSL 1 (best)4.82□□□□□ -1.644e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 LINS1-209ENST00000560783 511 ntTSL 54.75□□□□□ -1.654e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CASC3-202ENST00000394114 2792 ntTSL 24.74□□□□□ -1.654e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RAP1GDS1-216ENST00000511212 555 ntTSL 44.73□□□□□ -1.654e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 NBAS-207ENST00000441755 844 ntTSL 34.69□□□□□ -1.664e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PPP2CB-206ENST00000520334 578 ntTSL 24.66□□□□□ -1.664e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 BACH1-208ENST00000468059 663 ntTSL 34.65□□□□□ -1.664e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 BACH1-203ENST00000422809 850 ntTSL 54.65□□□□□ -1.664e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.674e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CSNK1G1-213ENST00000635270 830 ntTSL 54.59□□□□□ -1.674e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SENP5-203ENST00000434433 622 ntTSL 34.55□□□□□ -1.683e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.694e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PDS5A-207ENST00000507766 4196 ntTSL 24.49□□□□□ -1.695e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PDCD4-204ENST00000462577 789 ntTSL 54.43□□□□□ -1.73e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TCERG1-209ENST00000509810 784 ntTSL 24.43□□□□□ -1.74e-11■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.714e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.714e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.714e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MTHFD1L-205ENST00000421497 373 ntTSL 34.33□□□□□ -1.724e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 BAG1-209ENST00000493917 526 ntTSL 54.32□□□□□ -1.724e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.724e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SERAC1-207ENST00000607742 5155 ntTSL 1 (best)4.23□□□□□ -1.734e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MPP1-214ENST00000488694 550 ntTSL 24.18□□□□□ -1.744e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 IFT52-206ENST00000468420 648 ntTSL 54.15□□□□□ -1.754e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ELMO2-214ENST00000480042 506 ntTSL 34.11□□□□□ -1.754e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.774e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.794e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE2Q2-202ENST00000426727 2158 ntTSL 1 (best)3.78□□□□□ -1.84e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MLH1-202ENST00000413212 684 ntTSL 53.72□□□□□ -1.814e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 NBAS-205ENST00000429842 638 ntTSL 33.71□□□□□ -1.824e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ADAM10-202ENST00000396136 2418 ntTSL 1 (best)3.68□□□□□ -1.821e-6■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SNX1-205ENST00000559339 101 ntTSL 1 (best)3.67□□□□□ -1.824e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RBL1-203ENST00000525052 763 ntTSL 33.61□□□□□ -1.831e-6■■■■■ 30.4
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1197.2 ms