Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms