Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms