Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms