Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms