Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms