Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1Q5T2W1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms