Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM48Q5RL73 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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