Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms