Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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